دانشکده مهندسی عمران فعالیت خود را در سال ۱۳۶۵ به عنوان گروه عمران آغاز و از سال ۱۳۸۷ تحت عنوان دانشکده مهندسی عمران تاکنون به فعالیت خود ادامه داده است. رشته مهندسی عمران در دانشگاه آزاد اسلامی واحد جامع مستقل نجف آباد بیش از سی و هشت سال قدمت دارد و فارغ التصیلان این دانشکده هم اکنون در اقصی نقاط کشور به عنوان، مهندس مجری، ناظر، محاسب، پیمانکار، محقق، هیات علمی و .... مشغول به کار هستند. این دانشکده دارای 21 نفر عضو هیات علمی تمام وقت در گرایش­های مختلف می­باشد، که این تعداد هیات علمی در دانشکده­های عمران دانشگاه­های آزاد مختلف کشور کم نظیر است. امکانات آزمایشگاهی دانشکده مهندسی عمران در سطح مطلوبی می­باشد. با توجه به امکانات و شرایط مناسب، داوطلبان زیادی از سراسر کشور این دانشکده را برای ادامه­ی تحصیل خود انتخاب می­کنند، به نحوی که هم اکنون این دانشکده افتخار این را دارد که پذیرای بیش از 900 دانشجو در مقطع کارشناسی، بیش از 200 دانشجو در مقطع کارشناسی ارشد و حدود 100 نفر دانشجو در مقطع دکترای تخصصی باشد.